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 按致病作用

目前國(guó)際公認(rèn)的分類，主要有六個(gè)種類的大腸桿菌，即能夠致使胃腸道感染的腸道致病性的大腸桿菌（EPEC）、腸道產(chǎn)毒素性的大腸桿菌（ETEC）、腸道侵襲性的大腸桿菌（EIEC）、腸道出血性的大腸桿菌（EHEC）、腸集聚性的大腸桿菌（EAEC）以及近年來(lái)發(fā)現(xiàn)的腸產(chǎn)志賀樣毒素同時(shí)具有一定侵襲力的大腸桿菌（ESIES），另外，還有能夠致使尿道感染的尿道致病性的大腸桿菌（UPEC），以及最新命名的腸道集聚性的黏附大腸桿菌（EAggEC）。

 按溶血性

根據(jù)大腸桿菌的感染性狀能否產(chǎn)生溶血素和有無(wú)溶血的能力，可將大腸桿菌分為兩大類：即溶血性的大腸桿菌和非溶血性的大腸桿菌。

 按產(chǎn)腸毒素性

根據(jù)大腸桿菌在感染過(guò)程中能否產(chǎn)生腸毒素的能力，可將大腸桿菌分為兩大類：即產(chǎn)腸毒素性的大腸桿菌和非產(chǎn)腸毒素性的大腸桿菌。產(chǎn)腸毒素性的大腸桿菌是人和多種動(dòng)物的任何感染性腹瀉的重要病原，鑒定產(chǎn)腸毒素性的大腸桿菌主要是測(cè)定所分離大腸桿菌分泌的腸毒素的類型。除此之外，也可以根據(jù)大腸桿菌產(chǎn)生腸毒素的能力，結(jié)合其對(duì)不同腸毒素的敏感性，而將大腸桿菌分型，稱為腸毒素型。